黄喉拟水龟怎么分纯种？
这个。。。黄喉的纯种和杂交是生物分类里面的概念，指的是个体繁殖的后代在遗传上的相似性。而题主说的应该是品种的概念，这个概念在动物分类里面叫做品种（或称亚种），比如我们常说的“狮虎兽”，其实就是雄狮与雌虎配种的产物，属于两个物种，但人工培植的基因型相似的个体。 物种(species)是一个自然分类术语。它是在物种进化过程中天然形成的物种集合体，它们共享许多相似的遗传特征。但同一个物种的不同个体之间仍然可能会有细微的遗传差异。这种微小的遗传差异会通过遗传性状表现出来，也就是外表的差别。因此我们可以通过观察外部特征来初步判断一个物种。
但正如@王守崑老师所说，鉴定物种的外部形态是非常困难的，需要相当多的经验做支撑。更何况我们这里讨论的是两个近亲的物种呢！ 不过，虽然我们不能精准鉴定出黄喉拟水龟是否是纯种，但我们还是可以找到一些判断的依据。
1、形态学判断依据——近似于黑颈乌龟，但头部较小；背甲较平、不突起；腹甲较小；颈部较短且躯干较为粗壮等。具体可以查阅我这篇文章 2、遗传标记判断依据——线粒体DNA（mtDNA）分析 因为线粒体DNA呈母系遗传，突变速率快，能够提供较为原始的种群遗传信息。已有研究利用该技术验证了不同地理种群黄喉拟水龟的遗传差异[2]，所以我们可以据此判断不同个体间的遗传关系。 不过，需要注意的是，由于mtDNA只存在于细胞质中，并且线粒体DNA复制时会发生片段丢失，所以不能获得完整的基因组序列。而且，mtDNA的分析只能反应种群的遗传结构而不能反映群体进化的路径。
3、分子生物学判断依据——核DNA（nDNA）单倍型分析 尽管mtDNA能提供部分遗传信息，但它只能反映染色体基因组的单个拷贝，而在自然界中，物种往往由多个核基因组拷贝聚合而成。所以需要分析多个拷贝之间的异同，即单倍型分析，才能更全面地反映群体的遗传变异情况。 有学者利用该技术分析了我国黄喉拟水龟的基因多样性水平[4]，发现了影响黑色素合成相关基因的多态性位点，这些位点的基因型能在一定程度上影响到颜色表现型，即黑色/黄色。所以从理论上来说，可以通过检测色素合成的相关基因型来判定纯种与否。 但实际上并不如理想的那样简单。首先，不同地理群体的黄喉拟水龟往往已经适应了当地的环境并具有了相似的表型，所以难以区分它们是由不同的父本母本杂交而来还是仅由单个父本或母本聚合而成；其次，不同地区群体之间可能会交换染色质而使得基因频率发生改变，导致杂合子所占比例升高，甚至会出现纯合子消失的情况。最后，即使找到了能显著影响表型的基因型，在鉴定时也必须确保其他影响表型的基因型在该样本中不存在，否则就很有可能带来错误的结果。
总之，要鉴定黄喉拟水龟纯种是否确实有一定难度，还需要更多的研究和探索。